„Największe” badanie mikrobiomu wpływa na zdrowie naszych jelit
Istnieją pierwsze wyniki największego badania, jakie kiedykolwiek badano ludzki mikrobiom. Mają one ważne konsekwencje dla naszych praktyk żywieniowych, oporności na antybiotyki i naszego zdrowia psychicznego.
W 2012 roku dr Rob Knight z University of California (UC) w San Diego, dr Jeff Leach, założyciel Human Food Project oraz dr Jack Gilbert, który jest dyrektor wydziału Microbiome Center na University of Chicago w Illinois, postanowił założyć American Gut Project.
Celem projektu było poznanie ludzkiego mikrobiomu - czyli zbioru genów kodujących wszystkie nasze mikroby.
W szczególności naukowcy chcieli wiedzieć, ile rodzajów bakterii żyje w naszych ciałach i gdzie oraz jak nasza dieta i styl życia wpływają na skład tych drobnoustrojów.
W tym celu wykorzystali tzw. Naukę obywatelską - praktykę, w ramach której społeczeństwo przyczynia się do badań, oferując swój czas i dane osobowe do analizy.
Pierwsze wyniki projektu są już dostępne i dostarczają wskazówek, co utrzymuje nasze jelita w zdrowiu i różnorodności bakteryjnej. Wyniki zostały opublikowane w czasopiśmie mSystems.
Naukowcy Citizen pomagają w badaniu mikrobiomu
W ramach projektu uczestnicy zapłacili 99 USD za zestaw do zbierania próbek bakterii z kału, jamy ustnej i skóry.
Musieli również odpowiedzieć na ankietę, pytając o ich ogólny stan zdrowia i wszelkie choroby, które mogli mieć, ich styl życia i praktyki żywieniowe.
W 2015 roku w ramach projektu zliczono 15 096 próbek dostarczonych przez 11336 osób ze Stanów Zjednoczonych, Wielkiej Brytanii, Australii i 42 innych krajów.
Następnie naukowcy wykorzystali sekwencjonowanie genomowe do analizy markera genetycznego zwanego 16S rRNA, cząsteczki unikalnej dla bakterii.
Zbadali również zestaw metabolitów w próbkach, aby przeanalizować inne cząsteczki i związki chemiczne, które mogą być obecne.
Wreszcie, naukowcy wykorzystali metodę zwaną metagenomiką strzelby - która jest innowacyjną i potężną metodą sekwencjonowania DNA - do kompleksowej analizy danych genetycznych.
Znaczenie zróżnicowanej diety roślinnej
Po pierwsze, wyniki sugerują, że bardziej zróżnicowana dieta roślinna zapewnia bardziej zróżnicowane bakteryjnie jelita.
W szczególności ci, którzy każdego tygodnia spożywali ponad 30 różnych rodzajów roślin, mieli znacznie bardziej zróżnicowane mikrobiomy niż ci, którzy spożywali tylko 10 lub mniej rodzajów roślin tygodniowo.
Jednak naukowcy zauważają, że te wyniki niekoniecznie oznaczają, że zwiększenie różnorodności drobnoustrojów jest korzystne dla czyjegoś zdrowia.
Po drugie, uczestnicy, którzy zgłosili, że jedzą więcej niż 30 rodzajów roślin tygodniowo, wydawali się mieć mniejszą oporność na antybiotyki.
Naukowcy odkryli mniej genów wskazujących na oporność na antybiotyki w próbkach kału tych osób - to znaczy mniej genów, które pomagają bakteriom uciec przed lekami.
Chociaż badanie jest czysto obserwacyjne i nie może wyciągnąć żadnych wniosków na temat związku przyczynowego, autorzy spekulują, że osoby, których dieta zawiera mniej roślin, mogą kompensować jedzeniem mięsa - które mogło być leczone antybiotykami - lub przetworzonej żywności, do której dodano antybiotyki. .
Bakterie jelitowe i zdrowie psychiczne
Wreszcie badanie ujawniło interesujące powiązania między składem bakterii jelitowych a chorobami psychicznymi.
Osoby, które zgłosiły, że żyją z zespołem stresu pourazowego (PTSD), schizofrenią, depresją lub chorobą afektywną dwubiegunową, porównano ze zdrowymi osobami z grupy kontrolnej, których dobrano pod względem wieku, płci i wskaźnika masy ciała (BMI).
Wyniki pokazały, że osoby, które zgłosiły problemy ze zdrowiem psychicznym, miały więcej bakterii wspólnych z innymi osobami, które zgłosiły podobne problemy, niż osoby z grupy kontrolnej.
Związek ten był silny niezależnie od płci, wieku czy położenia geograficznego. Badania sugerują również, że niektóre rodzaje bakterii mogą częściej występować u osób z depresją.
Odkrycia te wzmacniają związek między zdrowiem psychicznym a bakteriami jelitowymi w poprzednich badaniach.
Na przykład niedawne badanie podkreśliło związek między lękiem a brakiem pewnych zdrowych drobnoustrojów jelitowych. Inny stwierdził, że niektóre bakterie są zmienione u osób z PTSD.
W kierunku „mikrobiomu GPS”
Dr Daniel McDonald, dyrektor naukowy American Gut Project w UC San Diego School of Medicine, rozważa znaczenie tych odkryć. On mówi:
„Zaobserwowaliśmy znacznie większą różnorodność mikrobiologiczną niż w poprzednich mniejszych badaniach, co sugeruje, że jeśli spojrzymy na większą liczbę populacji, zobaczymy więcej różnorodności, co jest ważne dla określenia granic ludzkiego mikrobiomu”.
Knight ma podobne zdanie, mówiąc: „Ludzki mikrobiom jest złożony, ale im więcej próbek otrzymamy, tym szybciej będziemy w stanie odkryć wiele sposobów, w jakie mikrobiom jest powiązany z różnymi stanami zdrowia i chorobowymi”.
„Projekt American Gut jest dynamiczny, a sampli napływają codziennie z całego świata” - dodaje Knight.
„Analiza przedstawiona w tym artykule przedstawia jedną migawkę, ale ostatecznie chcemy wyjść poza tworzenie map mikrobiomu i stworzyć mikrobiom GPS, który powie Ci nie tylko, gdzie jesteś na tej mapie, ale także dokąd chcesz się udać i do czego zrobić, aby się tam dostać pod względem diety, stylu życia lub leków ”.
Dr Rob Knight
