Rak: Te 4 geny pomagają przewidzieć wynik
Obszerne badania nad rolą supresora nowotworu p53 pozwalają lepiej zrozumieć mutacje genetyczne odgrywające rolę w różnych formach raka, a także zidentyfikować cztery geny, które mogą pomóc w przewidywaniu perspektyw danej osoby.
Plik TP53 gen jest odpowiedzialny za kodowanie tego, co naukowcy nazywają białkiem nowotworowym p53 - supresorem guza, który może powstrzymać komórki przed zbyt szybkim podziałem i proliferacją.
Naukowcy dubbingowali TP53 „strażnik genomu” ze względu na jego kluczową rolę w zapobieganiu nowotworom i kontrolowaniu podziałów komórkowych.
Raki ludzkie często zawierają mutacje w TP53 gen, powodując niepowodzenie jednego z krytycznych mechanizmów obronnych przed rakiem.
Pierwsze badania, które zidentyfikowały TP53 mutacje w nowotworach ludzkich pojawiły się w latach 80. XX wieku i od tego czasu naukowcy poświęcili wiele czasu i zasobów na wyjaśnienie ich roli w raku.
Obecnie największe tego rodzaju badanie wykorzystuje próbki nowotworów od ponad 10 000 pacjentów z rakiem i analizuje 32 różne rodzaje raka, aby lepiej zrozumieć rolę TP53.
Dr Larry Donehower, profesor wirusologii molekularnej i mikrobiologii w Baylor College of Medicine w Houston w Teksasie, kierował nowymi badaniami, które ukazały się w czasopiśmie Raporty komórkowe.
Geny Telltale 4 mogą pomóc przewidzieć perspektywy
Dr Donehower i zespół wykorzystali pięć różnych platform danych do pobrania 10 225 próbek z 32 nowotworów. Korzystając z atlasu genomu raka (TCGA), naukowcy byli w stanie kompleksowo ocenić rolę szlaku p53 w tych 32 nowotworach.
Dr Donehower i współpracownicy porównali następnie dane TCGA z inną bazą danych 80 000 mutacji genetycznych, którą dr Thierry Soussi - profesor biologii molekularnej na Sorbonie w Paryżu we Francji - zgromadził przez 30 lat.
Naukowcy to odkryli TP53 mutacje występowały częściej u osób o gorszych perspektywach. Ponadto analiza wykazała, że „ponad 91% przypadków raka z TP53 mutacje wykazują utratę obu funkcji TP53 allele ”lub warianty genów.
Dr Donehower wyjaśnia: „W niektórych genach raka jedna kopia dwóch genów zostanie utracona lub zmutowana”, ale „ponad 91 procent wszystkich nowotworów traci oba TP53 genów, a nie tylko jednego ”.
Druga utrata allelu, jak piszą autorzy, nastąpiła w wyniku „mutacji, delecji chromosomów lub neutralnej wobec kopii utraty heterozygotyczności” - czyli duplikacji genów. Główny badacz zauważa również, że ten ostatni proces zachodził znacznie częściej, niż wcześniej sądzili.
Co ważne, w badaniu zidentyfikowano również cztery geny, które wykazywały nadekspresję u mutanta TP53 guzy. Zdaniem naukowców te cztery geny mogą „powiedzieć”, czy chory na raka ma dobre perspektywy, czy nie.
„Jeśli masz wysoką ekspresję tych czterech genów, masz pacjenta, u którego istnieje większe prawdopodobieństwo złego rokowania […] I odwrotnie, jeśli ten pacjent ma bardzo niską ekspresję tych genów, prawdopodobnie przeżyje dłużej i będzie miał dobre rokowanie ”.
Dr Larry Donehower
„To da ci lepszy obraz tego, jak sobie poradzi, niż tylko wiedzieć, czy jest mutantem TP53 czy nie ”- kontynuuje dr Donehower.
Wreszcie badanie jest silnie powiązane TP53 mutacje z niestabilnością genomu, co jest zgodne z TP53Jest typową rolą „strażnika genomu”.
Dr Donehower komentuje wyjątkowość nowych badań, mówiąc: „Większość badań dotyczy TP53 skup się na jednym typie raka ”.
„Patrząc na 32 różne typy raka, widzisz, że pewne wzorce utrzymują się niezależnie od typu raka”.
Współautor badania i dyrektor Cancer Genomics w Baylor College of Medicine, dr David Wheeler, również komentuje znaczenie tych odkryć.
Mówi: „Od tego czasu TP53 jest jednym z najważniejszych strażników w profilaktyce raka, im lepiej zrozumiemy ten gen, tym lepiej będziemy w stanie zrozumieć podstawową biologię raka. Doprowadzi to do lepszych terapii ”.
